《道诡异仙》漫画主要讲述了高中生李火旺的奇幻经历。

李火旺患有精神病，住在精神病院，无法上学。他拥有闭眼就能进入一个诡异修仙世界的能力。在修仙世界里，他被称作 “师傅” 的人抓去当药人，随时可能被炼制成丹药。

一开始，李火旺以为修仙世界是自己的幻觉。但后来他发现两个世界似乎都很真实，且存在紧密联系，一边的行为会在另一边有同步反应。例如，他曾试图倒卖修仙世界的物件来致富，结果导致现实世界中家人为他的病情付出沉重代价。

在修仙世界中，有着诡异的天道和异常的仙佛，李火旺难以分辨其真假，自身也陷入迷惘。他在这个世界历经诸多磨难与考验，如面对把药童抓去当药引、用活人的血肉炼丹的邪修师傅丹阳子。同时，司命以凡人之身乃至天灾形式呈现，三界之间的关系若即若离。

随着故事发展，李火旺得知自己是心素，这是道诡世界中颇为罕见的存在，其全身上下可被拆成法器，因此他不断遭受各方势力追杀。不过，心素也有先天优势，他能通过修真功法将幻想变为真实。李火旺修真大成后，现实世界与道诡世界的隔膜被打破，两边世界再次产生紧密的相互影响。

原来，这一切背后是三清的阴谋，三清掌握秘密天道，被福生天蛊惑，为保留法身火种，甘愿牺牲化身和报身，布局吞噬其他天道。而福生天则企图通过恐惧和绝望控制、腐化三清，达到不战而胜的目的。

最终，李火旺在经历一系列事件后，通过医生易东来的催眠等方式，在两个世界中不断挣扎与成长，逐渐揭示出世界的真相，并努力在混乱的世界中寻找自己的生存之道和意义。在故事的结尾，现实世界的李火旺被治好了，道诡世界的火子哥虽失去一切，但在牛心村浑浑噩噩活着，世界也逐渐恢复正常。